Desde el siglo XVI la ruta principal atravesaba el centro-sur del Estado de Querétaro; pasaba por los llanos del Cazadero y enseguida bajaba a San Juan del Río, lugar que se convirtió en un enclave muy importante para entrar al norte de la Nueva España, ya que era un punto de aprovisionamiento y descanso de viajeros y comerciantes; además, de ahí partía el camino que llevaba hacia la zona minera de la Sierra Gorda.

Debido a las lluvias, fue necesario construir un puente provisional para cruzar el Río San Juan, y posteriormente, a principios del siglo XVIII, un puente de cal y canto, conocido actualmente como puente de la Historia. El camino, muy similar a la actual autopista México-Querétaro, se bifurca: la vía de la Izquierda llevaba a Santiago de Querétaro, y el de la Derecha evitaba la ciudad y pasaba por un conjunto de haciendas como Amazcala y Chichimequillas.